R语言taxa——taxa包中的类

Package taxa version 0.4.2

  • taxa_taxon-class
  • taxa_taxonomy-class
  • taxa_taxon_authority-class
  • taxa_taxon_db-class 
  • taxa_taxon_id-class
  • taxa_taxon_rank-class

taxon

        保存类群的基本信息，包括名称，等级和ID。

taxon(name = character(0), rank = NA, id = NA, auth = NA, .names = NA, ...)

参数【name】：类群的名称。

参数【rank】：类群的等级。

参数【id】：类群的ID。

参数【auth】：类群的所有权。

参数【.names】：向量的名称。

参数【...】：其他参数。

taxon_authority

        保存类群的所有权信息，包括作者名，日期和引用信息。

taxon_authority(
author = character(),
date = "",
citation = "",
.names = "",
extract_date = TRUE
)

参数【author】：0或作者名。

参数【date】：0或日期。

参数【citation】：0或文献信息。

参数【.names】：向量的名称。

参数【extract_date】：为TRUE时（默认），如果在author中包括日期而date没有信息，那么将从author中提取date信息。

taxon_db

        用来保存 db_ref 定义的类群数据库。

taxon_db(db = character(), .names = NULL, ...)

参数【db】：0或类群数据库名称。

参数【.names】：向量的名称。

参数【...】：其余参数。

taxon_id

        用来保存类群的ID。特别用来在 taxon 对象中保存类群ID。

taxon_id(id = character(), db = "", .names = NULL)

参数【id】：0或类群ID。

参数【db】：ID 关联的数据库名称。

参数【.names】：向量的名称。

taxon_rank

        保存类群的等级。特别用来在 taxon 对象中保存类群等级。

taxon_rank(
rank = character(),
.names = NULL,
levels = NULL,
guess_order = TRUE
)

参数【rank】：0或分类等级名称。

参数【.names】：向量的名称。

参数【levels】：一种命名的数字向量，指示可能的分类等级的名称和顺序。较高的数字表示精细的分组。未知的等级可以用NA代替数字来表示。

参数【guess_order】：如果TRUE并且没有使用数字给出排名顺序，则尝试根据排名名称猜测顺序。